Xromosoma konformatsiyasini ushlash (3C)ga asoslangan usullar xromatin boʻylab juft nuqtalarning jismoniy yaqinligini aniqlash orqali yadro ichidagi xromosomalar tuzilishini aniqlaydi. Ular xromatin oʻzaro taʼsirini oʻzaro bogʻlanish, soʻngra oʻzaro taʼsir qiluvchi hududlarni parchalash, bogʻlash va ketma-ketlashtirish orqali saqlaydi.
Xromosoma konformatsiyasi qanday ishlaydi?
Xromosoma konformatsiyasini chipda ushlash (4C) bir lokus va boshqa barcha genomik lokuslar oʻrtasidagi oʻzaro taʼsirlarni ushlaydi. Bu teskari PCRni amalga oshirish uchun ishlatiladigan o'z-o'zidan aylanali DNK parchalarini yaratish uchun ikkinchi ligatsiya bosqichini o'z ichiga oladi. … Bitta mikromassivda millionga yaqin shovqinni tahlil qilish mumkin.
Xromatin konformatsiyasini ushlash nima?
Xromatin konformatsiyasini ushlash (3C) xromatin tuzilishini oʻrganishda foydalaniladigan muhim texnikadir, shuningdek, bir qancha boshqa hosilaviy texnikalar uchun asosdir. … Protokol hujayralarning formaldegid o‘zaro bog‘lanishini, so‘ngra xromatin izolyatsiyasini va cheklovchi ferment yordamida hazm qilishni o‘z ichiga oladi.
Hi-C sequencing qanday ishlaydi?
Hi-C yondashuvi xromatin kontaktlarini genom boʻylab xaritalash uchun 3C-Seqni kengaytiradi va u in situ xromatin oʻzaro taʼsirini oʻrganishda ham qoʻllaniladi. Bu usulda DNK-oqsil komplekslari formaldegid bilan o'zaro bog'lanadi. Namuna parchalanadi va DNK ajratiladi, bog'lanadi va cheklovchi fermentlar yordamida hazm qilinadi.
Hi-C texnikasi nima?
Klassik Hi-C texnikasi ketma-ket o'ziga xos cheklovchi fermentlar bilan formaldegid o'zaro bog'langan genomni cheklash hazm qilishni o'z ichiga oladi, so'ngra hazm qilingan uchlarini o'z ichiga olgan holda to'ldirish va tiklashni o'z ichiga oladi. biotin bilan bog'langan nukleotidlar. Keyin ta'mirlangan uchlari qayta bog'lanadi.