Gomologiyadan qachon foydalanish kerak?

Mundarija:

Gomologiyadan qachon foydalanish kerak?
Gomologiyadan qachon foydalanish kerak?
Anonim

Gomologiya modellari ham tuzilmaviy ravishda hal etilmagan tegishli oqsillar orasidagi nozik farqlarni aniqlash uchun ishlatilishi mumkin . Masalan, usul Na+/K+ ATPazdagi kationlarni bog'lash joylarini aniqlash va turli ATPazlarning bog'lanish yaqinligi haqida farazlarni taklif qilish uchun ishlatilgan..

Gomologik modellar nima uchun ishlatiladi?

Gomologiyani modellashtirish - bu proteinning 3D tuzilishini uning aminokislotalar ketma-ketligidananiqlashda ishlatiladigan hisoblash strukturasini bashorat qilish usullaridan biri. Hisoblash strukturasini bashorat qilish usullaridan eng aniqi hisoblanadi. U oddiy va qoʻllash oson boʻlgan bir necha bosqichlardan iborat.

Gomologik modellashtirish nima va u nima uchun kerak?

Gomologik modellashtirish shablon va maqsadli ketma-ketliklar oʻrtasidagi oʻxshashlikka asoslangan maqsadli oqsilning uch oʻlchovli tuzilishini oladi va bu usul membrana oqsillarini oʻrganishda samarali ekanligini isbotlaydi. GPCR kabi kristallanish qiyin, chunki u … ni yuqori darajada tushunish imkonini beradi.

Omologik modelni qanday yaratasiz?

Gomologik modellashtirishda bir necha bosqichlar mavjud

  1. shablonni maqsad ketma-ketligingizdan foydalanib tanlang. Shu maqsadda siz barcha mavjud protein tuzilmalariga (PDB) qarshi BLASTp qidiruvini amalga oshirishingiz mumkin. …
  2. Shablon va maqsad ketma-ketligini moslashtirish. …
  3. Modelingiz sifati. …
  4. Aniqlashmos ravishda modelingiz.

Nima yaxshi homologik modellashtirishni ta'minlaydi?

Agar biz empirik tuzilmadan <=2 Å rmsd ga ega boʻlgan “juda muvaffaqiyatli homologiya modeli” deb taʼriflasak, shablon muvaffaqiyat uchun maqsad bilan >=60% ketma-ketlikka ega boʻlishi kerak. tarif >70%. Hatto yuqori ketma-ketlik identifikatorlarida ham (60%-95%), har oʻn homologiyali modeldan birida rmsd >5 Å vaga ega.

Tavsiya:

Qiziqarli maqolalar
Yangi o'sgan o'tlarni qachon kesish kerak?
Ko'proq o'qish

Yangi o'sgan o'tlarni qachon kesish kerak?

Yangi maysazorlar birinchi marta kesishdan oldin ildiz otishi uchun vaqt kerak. Ekilgan maysalar uchun ular oʻrib olishga tayyor boʻlgunga qadar 2 oygacha vaqt ketishi mumkin. Soda ekilganidan keyin 2-3 hafta ichida oʻrib olishga tayyor boʻlishi mumkin.

Burdizzo kastratoridan qanday foydalanish kerak?
Ko'proq o'qish

Burdizzo kastratoridan qanday foydalanish kerak?

Burdizzo usuli Asbobni 15-20 soniya yopiq holda qoldiring. Spermatik simni emaskulatorni yopishdan oldin va keyin uning jag'larida his qilishingizga ishonch hosil qiling. Jag'larni oching va asbobni taxminan 2 sm pastga siljiting va skrotumning boshqa tomonini ezib tashlang.

Biznes egasi qachon?
Ko'proq o'qish

Biznes egasi qachon?

Har qanday jismoniy shaxs yoki shaxslar guruhi dastlab qanchalik kichik biznes boʻlmasin tijorat tashkilotini boshqarish uchun birgalikda resurslar tashkil etgan va birlashtirgan har qanday jismoniy shaxs yoki shaxslar guruhi hisoblanadi. biznes egasi.