BLAST bir nechta maqsadlarda ishlatilishi mumkin. Bularga turlarni aniqlash, domenlarni aniqlash, filogeniyani aniqlash, DNK xaritalash va taqqoslash kiradi. BLAST yordamida siz turni toʻgʻri aniqlashingiz yoki gomologik turlarni topishingiz mumkin.
BLAST nima uchun ishlatiladi?
BLAST – bu kompyuter algoritmi boʻlib, u Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi (NCBI) veb-saytida va boshqa koʻplab saytlarda foydalanish mumkin. BLAST soʻrovi DNK ketma-ketligini ketma-ketliklar maʼlumotlar bazasi bilantez moslashtirishi va solishtirishi mumkin, bu esa uni davom etayotgan genomik tadqiqotlarda muhim vositaga aylantiradi.
BLAST texnikasi nima?
BLAST texnikasi bu Albert Barneto tomonidan ishlab chiqilgan shikoyatni hal qilish usulidir. Mnemonika “Ishoning, tinglang, kechirim so'rang, qoniqtiring va rahmat” degan ma'noni anglatadi (1-jadval). 6. Ushbu maqolada uning bemorlarni parvarish qilishda va klinik oʻqitish vositasi sifatida foydalanish foydaliligi tasvirlangan.
BLAST DNKni qanday ishlaydi?
BLAST qanday ishlaydi? BLAST evristik usul yordamidagomologik ketma-ketliklarni aniqlaydi, bu esa dastlab ikkita ketma-ketlik orasidagi qisqa mosliklarni topadi; shunday qilib, usul butun ketma-ketlik maydonini hisobga olmaydi. Dastlabki oʻyindan soʻng, BLAST ushbu dastlabki moslashuvlardan mahalliy moslashishni boshlashga harakat qiladi.
Nega BLAST Fasta'dan tezroq?
Algoritmning ishlash vaqtining murakkabligi nuqtai nazaridan, BLAST FASTA ga qaraganda tezroq, faqat eng muhim naqshlarni qidirish orqali.ketma-ketliklar. BLAST va FASTA sezgirligi (yoki aniqligi) nuklein kislota va oqsil ketma-ketligi uchun har xil bo‘ladi (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
