Molekulyar biologiyada STRING (Oʻzaro taʼsir qiluvchi genlar/oqsillarni qidirish uchun vosita) maʼlum va prognoz qilingan oqsil-oqsil oʻzaro taʼsirining biologik maʼlumotlar bazasi va veb-resursidir. … 11b oxirgi versiyasida 5000 dan ortiq organizmlarning 24,5 million oqsillari haqida maʼlumotlar mavjud.
STRING ma'lumotlar bazasi nima maqsadda?
STRING maʼlumotlar bazasi koʻp sonli organizmlar uchun maʼlum va bashorat qilingan protein – oqsil assotsiatsiyasi maʼlumotlarini birlashtirish orqali ushbu maʼlumotlarni toʻplash va birlashtirishga qaratilgan.
STRING ball nima?
STRINGda har bir oqsil-oqsil oʻzaro taʼsiri bir yoki bir nechta “ballar” bilan izohlanadi. Muhimi, bu ballar o'zaro ta'sirning kuchini yoki o'ziga xosligini ko'rsatmaydi. Buning oʻrniga ular ishonch koʻrsatkichlari, yaʼni STRING oʻzaro taʼsirni qanchalik toʻgʻri deb baholaydi, mavjud dalillarni hisobga olgan holda.
Oqsillar nima uchun oʻzaro taʼsir qiladi?
Oqsil-oqsil o'zaro ta'siri (PPI) - bu elektrostatik kuchlar, vodorodni o'z ichiga olgan o'zaro ta'sirlar orqali boshqariladigan biokimyoviy hodisalar natijasida ikki yoki undan ortiq oqsil molekulalari o'rtasida o'rnatilgan yuqori o'ziga xoslikdagi jismoniy kontaktlar. bog'lanish va hidrofobik ta'sir.
Funktsional assotsiatsiya nima?
ta'rifi. Biologik mavjudotlar oʻrtasidagi ikkilik munosabatlar ulardan biri ikkinchisining funktsiyasi, ifodasi, degradatsiyasi yoki barqarorligi va munosabatlar nuqtai nazaridan boshqasini modulyatsiya qilgandasheriklar o'rtasidagi munosabatlarni to'g'ridan-to'g'ri aniqlash mumkin emas, shuning uchun oraliq bosqichlar bevosita mavjud.
